Ingresó a esta institución pese a tener el más bajo puntaje curricular; sin embargo, logró ocupar uno de los primeros puestos gracias a entrevista personal.
A menos de dos meses de iniciadas sus funciones, la Junta Nacional de Justicia emprendió procesos disciplinarios e investigaciones contra varios fiscales y jueces.
La Comisión Especial anuló la elección de Falconí como miembro titular de la Junta Nacional de Justicia. En su reemplazo, asumirá funciones el abogado Augusto Thornberry.
Glatzer Tuesta, directivo de IDL, despotricó contra Marco Falconí, María Zavala y la Comisión Especial de la JNJ, pero rescató cualidades de Abraham Siles, abogado que quedó como suplente.
En cambio, la comisión decidió revisar el nombramiento de Marco Falconí por supuestas irregularidades en la bonificación del 10 % que obtuvo por su servicio militar.
Una respuesta sarcástica de Marco Falconí generó el enfado de Marianella Ledesma: "No es que tenga una debilidad mental para entender lo que usted ha señalado", le llegó a decir.